ホームページ制作費は通常「人月」単位で算出します。
「人月」というと馴染みが薄いかもしれませんが、「1人が1ヶ月掛かってこなす作業量に対する単価」のことです。オフィスあんどぷらすでは人月単価100万円で設定しています。

わかりやすいように下記には作業項目ごとの単価目安を表記してあります。

企画構成費
ネットショップ 80,000円~、企業サイト 50,000円~
オープンソースインストール費
Nucleus 20,000円~、Zen Cart 30,000円~
オープンソース初期設定費
Nucleus 10,000円~、Zen Cart 20,000円~
テンプレート（スキン）制作費
Nucleus 120,000円~、Zen Cart 180,000円~
固定ページ制作費
7,000円~
プラグイン（モジュール）インストール費
2,000円~
プラグイン（モジュール）設定費
5,000円~
キーワード選定費
15,000円~
SEO対策費
50,000円~
プラグイン（モジュール）カスマタイズ費
30,000円~
DBカスタマイズ費
10,000円~
商品詳細ページ機能カスタマイズ
30,000円~
一覧ページページ機能カスタマイズ
30,000円~
トップページ機能カスタマイズ
50,000円~
オリジナルロジック制作
50,000円~
コアファイルカスタマイズ
50,000円~

上記は一応の目安です。内容により前後しますのでお問い合わせください。
その際には具体的なご要望をお聞かせいただけるとお見積もりがスムーズに提示できます。

概ね、企業サイト（Nucleusで構築）が30万円~、ネットショップ（Zen Cartで構築）が50万円~となります。
どちらも機能カスタマイズなしの場合の料金です。